航空： 南通机场位于市区东北12公里的通州市兴东镇。市区人民中路9号民航售票处有民航班车前往，问讯电话：0513-6560588。市区人民中路9号有民航班车前往，问讯电话：6560588。
铁路：南通是目前我国14个沿海开放城市中惟一不通火车的城市，建设中的新长铁路(新沂--长兴)有支线从海安通往南通。
水路：南通是我国十大港口之一，也是长江水系江河运输直达中转的枢纽。南通与上海每天有两班快艇往返。上海--汉口、上海--重庆的江轮均停靠南通。从市区、长途车站到南通港可乘4路车直达，问讯电话：0513-3512270。
车渡：“南通”往南因长江阻隔，要通过通沙(南通市天生港--张家港市西界港)、通常(通州市省军区农场--常熟市浒浦镇)、海太(海门市江心沙农场--太仓市鹿河镇)、海崇(海门市青龙港--上海市崇明县牛棚港)汽渡与苏南和上海交往。世界上跨度最大的“苏(州)--(南)通长江大桥”已开工建设，2007年建成通车后，南通将彻底改变“南不通”的历史。
公路： 南通长途汽车站位于人民西路86号，问讯电话：0513-3512816。
市内交通：出租车起步价6元。